تتنوع فوائد الخمائر الطبيعية الموجودة في الأمعاء، وتلعب دوراً مهماً في صحة الإنسان، وتحديداً في مدى تعرضه للسمنة
.
وتسهم هذه الفطريات الطبيعية بتسهيل عمليات هضم اللاكتوز إلى حمض اللاكتيك، ما يؤدي لسهولة هضمه خاصة لدى الرضع.
حديثاً، أشارت أبحاث طبية إلى دور هذه الخمائر في الوقاية من سرطان الأمعاء، حيث تعمل بعض أنواعها على مقاومة حدوث الطفرات في الخلايا الهضمية، إضافة إلى خفض الكولسترول في الدم.
وتعد الخمائر الطبيعية من بين أهم المكملات الغذائية، التي يصفها الأطباء لمن يعاني عسر الهضم، وحتى محاربة السمنة وهي غنية بالفيتامينات التي تنشط الدورة الدموية، وايضاً تحفظ التوازن الغذائي داخل أعضائه.